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教授
镰地佑介

专业领域
实验室/研究办公室 分子发育生物学实验室
在动物发育中，细胞分裂并随后以时空受控的方式分化成不同的细胞类型，从而形成组织和器官。我们的小组正在研究这些过程如何受到分子调控，特别强调基因表达机制。为了解决这些问题，我们的研究结合了基因组编辑技术和斑马鱼这种小型热带鱼。
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研究活动

研究论文
  1. 作者：Kanae Aoki、Mai Yamasaki、Riku Umezono、Takanori Hamamoto、Yusuke KAMACHI
    标题：基于桑格测序的基因组编辑分析的计算工具的系统比较
    期刊：细胞，卷。 13，第 3 期，第 13 页。 261、MDPI
    年份：2024 年
  2. 作者：冈田启太、青木佳苗、田井照之、杉尾幸太、今井胜典、本科原由纪、镰地佑介
    标题：与野生型或 HiFi Cas9 组装的双引导 CRISPR-Cas9 核糖核蛋白复合物的 CRISPR RNA 的关键序列特征
    期刊：核酸研究，牛津大学出版社
    年份：2022 年
  3. 作者：Chamila Deshani Ranawakage、Keita Okada、Kota Sugio、Yuya Kawaguchi、Yuki Bonkohara、Takuya Takada、KAMACHI YUSUKE
    标题：使用长 ssDNA 作为供体，通过 CRISPR-Cas9 介导的斑马鱼复合标签的高效敲入
    日记：正面。细胞开发。生物学，卷。 8，p。 598634，前沿媒体 SA
    年份：2020 年
  4. 作者：Ranawakage Chamila Deshani、Takuya Takada、Yusuke Kamachi
    标题：HiBiT-qIP，基于 HiBiT 的定量免疫沉淀，有助于在免疫沉淀条件下测定抗体亲和力
    期刊：科学报告、施普林格自然
    年份：2019 年
  5. 作者：冈本佑、西村直子、松田一成、Rawakage Chamila Deshani、Yusuke Kamachi、Hisato Kondoh、Masanori Uchikawa
    标题：Sall4 和 Sox8 转录因子在耳基板发育过程中鸡 Sox3 基因调控中的合作
    期刊：发展、增长和分化，卷。 60号，第3号
    年份：2018
  6. 作者：Yasumi T、Inoue M、Maruhashi M、KAMACHI YUSUKE、Higashi Y、Kondoh H、Uchikawa M
    标题：鸡胚中δEF1和Sip1对躯干神经嵴分层的调节。
    期刊：开发者。生长。不同，卷。 58，第 205-214 页，威利
    年份：2016 年
  7. 作者：Morimura H、Tanaka SI、Ishitobi H、Mikami T、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H、Inouye Y
    标题：使用等离子体纳米二聚体对转录因子复合物结合诱导的 DNA 构象变化进行纳米分析。
    期刊：ACS Nano，卷。 23，第 10733-10740 页
    年份：2013 年
  8. 作者：Iwafuchi-Doi M、Yoshida Y、Onichtchouk D、Leichsenring M、Driever W、Takemoto T、Uchikawa M、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：保守增强子 N2 的 Pou5f1/Pou3f 依赖性但 SoxB 独立调节可在脊椎动物的外胚层到神经板阶段启动 Sox2 表达。
    期刊：开发者。生物学，卷。 352，第 354-366 页
    年份：2011 年
  9. 作者：Kobayashi I、Kojima K、Uchino K、Sezutsu H、Iizuka T、Tatematsu K、Yonemura N、Tanaka H、Yamakawa M、Ogura E、KAMACHI YUSUKE、Tamura T
    标题：使用 GAL4 变体在家蚕 Bombyx mori 中进行基因表达的高效二元系统。
    期刊：Arch。昆虫。生物化学。生理学，卷。 76，第 195-210 页
    年份：2011
  10. 作者：Okuda Y、Ogura E、Kondoh H、KAMACHI YUSUKE
    标题：B1 SOX 协调细胞规范与早期斑马鱼胚胎中的图案形成和形态发生。
    期刊：PLoS Genet，卷。 6，第 5 期，第 4 页。 e1000936
    年份：2010 年
  11. 作者：Ogura E、Okuda Y、Kondoh H、KAMACHI YUSUKE
    标题：GAL4 激活剂对斑马鱼 GAL4 增强子捕获的适应性。
    期刊：开发者。动态，卷。 238，第 641-655 页
    年份：2009 年
  12. 作者：Mon H、Sugahara R、Hong SM、Lee JM、KAMACHI YUSUKE、Kawaguchi Y、Kusakabe T
    标题：培养昆虫细胞中蛋白质与双杂交系统的相互作用分析。
    日记：肛门。生物化学，卷。 392，第 180-182 页
    年份：2009 年
  13. 作者：KAMACHI YUSUKE、Okuda Y、Kondoh H
    标题：使用荧光素酶测定定量评估吗啉代反义寡核苷酸在斑马鱼胚胎中的敲低效率。
    期刊：创世记，卷。 46，第 1-7 页
    年份：2008 年
  14. 作者：Kanamori A、Toyama K、Kitakawa。 S，龟原。 A、樋口。 T、镰地佑介、木下。 M，堀。 H
    标题：figα 表达的比较基因组学方法，figα 是青鳉 (Oryzias latipes) 卵母细胞分化的最早标记基因之一。
    期刊：基因，卷。 423，第 180-187 页
    年份：2008 年
  15. 作者：Sato N、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H、Shima Y、诸桥 K、Horikawa R、Ogata T
    标题：患有 SOX2 杂合性低效突变的成年女性的低促性腺激素性性腺功能减退症。
    期刊：欧洲。 J内分泌学，卷。 156，第 167-171 页
    年份：2007 年
  16. 作者：Yasuhara N、Shibazaki N、Tanaka S、Nagai M、Kamikawa Y、Oe S、Asally M、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H、Yoneda Y
    标题：通过导入蛋白-α 的亚型转换触发 ES 细胞的神经分化。
    期刊：Nat。细胞。生物学，卷。 9，第 72-79 页
    年份：2007 年
  17. 作者：Inoue M、KAMACHI YUSUKE、Matsunami H、Imada K、Uchikawa M、Kondoh H
    标题：PAX6 和 SOX2 依赖性调节参与胚胎视觉系统发育的 Sox2 增强子 N-3。
    期刊：基因细胞，卷。 12，第 1049-1061 页
    年份：2007 年
  18. 作者：Okuda Y、Yoda H、Uchikawa M、Furutani-Seiki M、Takeda H、Kondoh H、KAMACHI YUSUKE
    标题：斑马鱼 B1 组 sox 基因的比较基因组和表达分析表明它们在脊椎动物进化过程中的多样化。
    期刊：Dev动态，卷。 235，第 811-825 页
    年份：2006 年
  19. 作者：Takemoto T、Uchikawa M、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：通过激活 Sox2 增强子 N-1，后神经板发生过程中 Wnt 和 FGF 信号的汇聚。
    期刊：发展，卷。 133，第 297-306 页
    年份：2006 年
  20. 作者：Blanco J、Girard F、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H、Gehring WJ
    标题：果蝇中鸡 delta1-晶状体蛋白增强子活性的功能分析揭示了鸡和果蝇之间显着的进化保守性。
    期刊：发展，卷。 132，第 1895-1905 页
    年份：2005年
  21. 作者：松又 M、内川 M、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：通过系统功能筛选鉴定出的多个 N-钙粘蛋白增强子表明其在神经和基板发育中具有 B1 组 SOX 依赖性调节。
    期刊：Dev生物学，卷。 286，第 601-617 页
    年份：2005年
  22. 作者：Tanaka S、KAMACHI YUSUKE、Tanouchi A、Hamada H、Jing N、Kondoh H
    标题：SOX 和 POU 因子在神经原始细胞巢蛋白基因调节中的相互作用。
    期刊：摩尔。细胞。生物学，卷。 24，第 8834-8846 页
    年份：2004 年
  23. 作者：Uchikawa M、Ishida Y、Takemoto T、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：鸡 Sox2 增强子的功能分析突出了哺乳动物中保守的一系列不同的调控元件。
    期刊：Dev细胞，卷。 4，第 509-519 页
    年份：2003 年
  24. 作者：Kuroiwa A、Uchikawa M、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H、Nishida-Umehara C、Masabanda J、Griffin KD、Matsuda Y
    标题：鸡体内八个 SOX 家族基因的染色体分配。
    期刊：Cytogenet。基因组研究，卷。 98，第 189-193 页
    年份：2002 年
  25. 作者：Muta M、KAMACHI YUSUKE、Yoshimoto A、Higashi Y、Kondoh H
    标题：SOX2、Pax6 和 Maf 转录因子在晶状体特异性 δ1-晶状体蛋白增强子调节中的独特作用。
    期刊：基因细胞，卷。 7，第 791-805 页
    年份：2002 年
  26. 作者：Olsson JE、KAMACHI YUSUKE、Penning S、Muscat GEO、Kondoh H、Koopman P
    标题：鸡胚胎发生过程中血管和羽芽中的 Sox18 表达。
    期刊：基因，卷。 271，p。 151-158
    年份：2001
  27. 作者：KAMACHI YUSUKE、Uchikawa M、Tanouchi A、Sekido R、Kondoh H
    标题：Pax6 和 SOX2 形成共 DNA 结合伴侣复合物，调节晶状体发育的启动。
    期刊：基因开发，卷。 15，第 1272-1286 页
    年份：2001 年
  28. 作者：Uchikawa M、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：B 组 Sox 基因的两个不同亚组，用于转录激活因子和抑制因子：它们在鸡胚胎器官发生过程中的表达。
    期刊：机械。开发，卷。 84，p。 103-120
    年份：1999
  29. 作者：KAMACHI YUSUKE、Cheah KSE、Kondoh H
    标题：通过 SOX1/2/3 和 SOX9 的比较揭示了 SOX 高迁移率基团结构域蛋白的调控靶标选择机制。
    期刊：摩尔。细胞。生物学，卷。 19，第 107-120 页
    年份：1999
  30. 作者：KAMACHI YUSUKE、Uchikawa M、Collignon J、Lovell-Badge R、Kondoh H
    标题：Sox1、2 和 3 参与晶状体诱导的早期和后续分子事件。
    期刊：发展，卷。 125，第 2521-2532 页
    年份：1998
  31. 作者：Masaki S、KAMACHI YUSUKE、Quinlan RO、Yonezawa S、Kondoh H
    标题：小鼠filensin基因启动子的鉴定和功能分析。
    期刊：基因，卷。 214，第 77-86 页
    年份：1998
  32. 作者：Sekido R、Murai K、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：阻遏物 δEF1 作用的两种机制：与激活剂的结合位点竞争和主动抑制。
    期刊：基因细胞，卷。 2，第 771-783 页
    年份：1997
  33. 作者：角川 Y、Kusakabe T、KAMACHI YUSUKE、Isobe K、Kondoh H、Ohyama T
    标题：含有 SV40 起点的鼠 Thy-12 报告载体，用于快速克隆和分析真核启动子。
    期刊：基因，卷。 153，第 277-278 页
    年份：1995
  34. 作者：KAMACHI YUSUKE、Sockanathan S、Liu Q、Breitman M、Lovell-Badge R、Kondoh H
    标题：SOX 蛋白参与晶状体蛋白基因的晶状体特异性激活。
    期刊：EMBO J，卷。 14，第 3510-3519 页
    年份：1995
  35. 作者：Sekido R、Murai K、Funahashi J、KAMACHI YUSUKE、Fujisawa A、Nabeshima Y、Kondoh H
    标题：δ-晶状体蛋白增强子结合蛋白 δEF1 是 E2-box 介导的基因激活的阻遏蛋白。
    期刊：摩尔。细胞。生物学，卷。 14，第 5692-5700 页
    年份：1994
  36. 作者：KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：重叠的正负调节元件决定了 δ1-晶状体蛋白增强剂的晶状体特异性活性。
    期刊：摩尔。细胞。生物学，卷。 13，第 5206-5215 页
    年份：1993
  37. 作者：Funahashi J、Sekido R、Murai K、KAMACHI YUSUKE、Kondoh H
    标题：δ-晶状体蛋白增强子结合蛋白 δEF1 是一种与原肠胚形成后胚胎发生有关的锌指同源结构域蛋白。
    期刊：发展，卷。 119，第 433-446 页
    年份：1993
  38. 作者：Funahashi J、KAMACHI YUSUKE、Goto K、Kondoh H
    标题：核因子 δEF1 及其结合位点的鉴定对于 δ1-晶状体蛋白增强剂的晶状体特异性活性至关重要。
    期刊：核酸研究，卷。 19，第 3543-3547 页
    年份：1991
  39. 作者：KAMACHI YUSUKE、Okawa E、Asano M、Ishida S、Murakami Y、Satake M、Ito Y、Shigesada K
    标题：与多核病毒增强子的 A 和 B 核心结合的小鼠核因子的纯化。
    期刊：J Virology，卷。 64，第 4808-4819 页
    年份：1990
日本政府的科学研究补助金
  1. 项目名称：Sox 转录因子调控 microRNA 基因
    类别：科学研究补助金 (B)
    项目编号：25290066
    项目周期：2013-2016
    总预算金额：18,330,000日元
    关键字：
  2. 项目名称：以组织特异性方式识别蛋白质-DNA 相互作用的方法的开发和应用
    类别：为具有挑战性的探索性研究提供资助
    项目编号：15K14527
    项目周期：2015-2017
    总预算金额：4,030,000日元
    关键字：
  3. 项目名称：细胞命运转换中Sox-伴侣因子复合物的体内功能分析
    类别：科学研究补助金 (C)
    项目编号：18K06267
    项目期限：2018-2020
    预算总额：4,420,000日元
    关键字：

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社交活动

委员会角色
  1. 科学报告编委会成员，2019 年-

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